1. Il Direttore è eletto dai Docenti del Collegio, tra i propri componenti esclusivi, professori di ruolo a tempo pieno dell’Ateneo di Trieste, ed afferenti ad una delle aree scientifiche di riferimento della Scuola.

Il Direttore dura in carica tre anni ed è rieleggibile per una sola volta consecutiva.
2. Il Direttore:

a) rappresenta la Scuola nei rapporti interni ed esterni;
b) convoca il Consiglio Scientifico;
c) convoca e presiede il Collegio dei Docenti e ne cura l'attuazione delle delibere;
d) organizza e coordina le attività della Scuola, ivi incluse quelle amministrative; nel caso di Scuole articolate in più indirizzi, le funzioni di organizzazione e coordinamento delle attività didattiche sono demandate ai Coordinatori di indirizzo previsti dal successivo art. 9;
e) presenta annualmente ai competenti Organi una dettagliata relazione sull'andamento della Scuola da sottoporre al preventivo esame del Nucleo di Valutazione anche ai fini del giudizio di cui al D.M. 224/1999;
f) presenta l’eventuale richiesta di rinnovo al termine dei tre cicli.
3. Il Direttore nomina un Vicedirettore che lo sostituisce nei casi di assenza o di impedimento.