Il CISC può disporre di fondi trasferiti dai Dipartimenti aderenti per la realizzazione di specifici progetti che intendano sostenere e di fondi erogati da:

a) Ministero dell’Istruzione, dell’Università e della Ricerca/MIUR;
b) Commissione dell’Unione Europea, attraverso programmi di sostegno alla ricerca ed alla formazione;
c) Università di Trieste, attraverso progetti di ricerca di Ateneo (PRA) ed altri strumenti;
d) Regione Autonoma Friuli - Venezia Giulia;
e) altri Enti pubblici di ricerca;
f) Soggetti pubblici e privati interessati a sostenere l’attività del CISC con contratti, contributi, donazioni, erogazioni in favore di Borse di Studio e altre forme di supporto.

Le richieste di finanziamento per progetti che ricadano sotto l’egida del CISC devono essere approvate dal Comitato del CISC e inoltrate al soggetto finanziatore, firmate dal responsabile del progetto e dal Coordinatore.
Il responsabile di un progetto realizzato sotto l’egida del CISC deve far approvare i rendiconti annuali e un rendiconto finale, scientifico e contabile, dal Comitato del Centro, e trasmetterli, se richiesti, a soggetti finanziatori attraverso il Coordinatore del Centro.
Inoltre il Centro puo' disporre di proventi derivanti da contratti per attivita' in conto terzi e da convenzioni con soggetti pubblici e privati.