Sono organi del Centro: il Comitato, il Responsabile e la Giunta (facoltativa).

Il Comitato è costituito da:

1. Due rappresentanti di ciascuno dei Dipartimenti proponenti, eletti in seno al rispettivo Consiglio;
2. Il Direttore del Dipartimento che agisce da centro di spesa pro-tempore (cfr. art. 7), qualora non sia già componente del Comitato ai sensi del precedente punto 1;
3. Un rappresentante per ciascuno dei gruppi di ricerca aderenti al Centro e non appartenenti ad uno dei Dipartimenti proponenti, limitatamente al periodo di adesione.

Il Responsabile è eletto dal Comitato e resta in carica per un triennio. Il Responsabile ha la rappresentanza del Centro, presiede il Comitato e la Giunta (ove costituita) e ne rende esecutive le delibere.
La Giunta, ove costituita, è composta dal Responsabile del Centro, dal Direttore del Dipartimento Centro di spesa pro-tempore e da uno dei rappresentanti dei Dipartimenti proponenti, eletto in seno al Comitato con la maggioranza dei due terzi dei presenti.
La Giunta ha durata triennale.